Çanakkale'ye bağlı olan Bozcaada, Ege Denizi’nin kuzey-doğusunda Çanakkale Boğazı’nın 12 deniz mili güneyinde yer alır. Çanakkale il merkezine 25 mil, Gökçeada’ya 17 mil, Limni’ye 26 mil, Midilli’ye 27 mil,şu anda ulaşımın sağlandığı Ezine İlçesi Geyikli Beldesi Yükyeri Feribot İskelesine 4 mil uzaklıktadır. Çevresi 38 km tutan Bozcaada’nın alanı 36.67 km² olup etrafındaki irili ufaklı 17 adacık (0.93 km²) dahil olmak üzere 37.6 km²’lik yüzölçümüne sahiptir. Bu adacıklardan en büyüğü 800 dönümlük arazisi ile halk arasında Tavşan Adası diye bilinen Mavriya Adası’dır.

Ada yeryüzü şekilleri bakımından genel olarak alçak ve basık bir yapıdadır. En yüksek noktası Göztepe’dir (192m). Bu tepenin tüm adayı kuşbakışı görebileceğiniz etkileyici bir manzarası vardır. Kışın akan ufak dereler dışında akarsuyu yoktur. Adanın iç kısımları genel olarak büyük düzlüklerden oluşmaktadır. Koylar ve burunlar adaya özgü yer şekilleridir. Ada’da 12 burun ve 12 koy, kuzey kıyılarında kumullar bulunmaktadır.

Bitki örtüsünün oluşmasında rüzgarın payı büyüktür. Adanın doğal bitki örtüsü maki ve ufak çalılıklardır. Yüzölçümünün 1/3’ünü ise bağlar kaplar. Adanın boz görünmesinin sebebi rüzgara açık kısımlarında ağaç yetişmemesidir. Ama iç kısımlarda bölge bölge çamlıklara rastlanır. Yapılan bir araştırmaya göre adada 65 familyaya ait 437 tür bitkinin olduğu tespit edilmiştir.